以下是從網路上找到的攻略概要
第一幕
1：組織船艦(S.H.I.E.L.D. Helicarrier)
敵人襲擊了SHIELD組織的巨艦，Spider-Man(蜘蛛人)、Wolverine (金剛狼)、Captain America (美國隊長)和Thor (雷神)開始抵禦敵人的進攻。首要的目標是前往艦橋與Nick Fury(獨眼龍)上校匯合，由起始處沿甲板左走上樓梯，進屋殺掉出現的成群機械人，沿著迷宮中的唯一路徑穿過去，上一道斜坡遇到第一個BOSS- Scorpion，他的攻擊武器是蠍鞭。
打敗Scorpion繼續前行，在艦橋遇到Nick Fury，他吩咐4位英雄去阻止核子導彈的發射。離開艦橋看到地上有綠色的圓圈，這裡是存檔點，並可以更換隊員，目前有月光超人、鐵甲人、橡皮人、隱形女俠和石頭人等10餘名隊員可選。整理完隊伍往右進屋子，發現能量裝置被敵人摧毀，控制台的電源被切斷，對面的電磁門暫時無法打開。跑下去先將損壞的能量裝置拖到一邊，從左側牆邊推動一台新設備推到原來的位置，再操作控制台打開電磁門。
穿過電磁門，在右側有兩道豎梯可爬上去，穿過兩道門便是核子導彈發射艙，Nick Fury說唯有破壞控制導彈的控制台才能阻止發射。由兩側的路分別過去摧毀兩座控制台，不料一枚導彈還是發射了出去，這時有5分鐘的時間前往導航室，在門口遇到殺手Bullseye，他會使用遠程攻擊，殺掉他拿到刺客視鏡，然後跑入導航室啟動控制台引爆飛行中的核子導彈。
這時得到敵人攻擊艦艇引擎的消息，由導航室下樓梯來到後面的兵營，看來這裡剛發生的爆炸，不遠處是Black Widow遺留的掌上電腦。往前走看到一些警衛被鎖在電磁門內，在附近找到一間控制室，跳過地上的雷射線，分別派兩名隊員站到控制台前操作，釋放出被囚在房間裡的警衛。每個房間里都有電腦，有興趣的話閱讀裡面的資訊。
往前走跳出窗戶來到外面的甲板，解決掉成群的敵兵來到引擎室，在這裡遇到冬日戰士和輻射能超人，與他們展開戰鬥，中途他們會被Dr. Doom叫走，在他們逃開後一路追隨，他們由上方的平台離開，解決掉圍攻的小兵，跳右側平台乘電梯追過去，最後到一間大廳與兩只BOSS展開決鬥，殺掉他們，Nick Fury隨後啟動附近的電梯。
乘電梯上去得到Nick Fury的消息，敵人派來一只巨型怪物攻擊主引擎，眾人沿著兵營上層的迷宮通道穿出去來到外面，看到一只綠色巨龍正朝艦船攻擊，在它朝地面噴射火球，或用前爪拍擊時要小心躲避，儘量用隊員的遠程技能攻擊。等他飛離時跑到艦首操作大砲朝天空轟擊(空格)，如此它會持續飛在空中，將它殺死後拿取龍心。
2：總部基地1(Stark Tower) [
這裡是正義方的基地，與Nick Fury和Black Widow交談了解一些背景資訊，在大廳陽台等處可收集升級部件。在兩側平台各有一座控制台，一側找到Vision交談，然後向Black Widow要來解碼模塊交給他。與Pym醫生交談，受托前往Omega基地拿回他的控制頭盔。走到窗前與Wingfoot交談，一行人乘飛船來到 Omega基地，阻止它撞向前方的大壩。
3：歐米加基地(Omega Base)
往左走遇到Dugan，交談後要護送他前往中央控制室。殺掉沿途的守衛，往左進入房間幹掉一名超級戰士，由右側的門轉過去來到有傳輸帶和齒輪的房間，Dugan提議眾人前去關閉主驅動，這樣基地會自動切換到備用驅動裝置。
沿通道前行摧毀兩只旋轉的齒輪傳送裝置，在樓梯附近拾到人偶1。上樓梯發現這間控制室已被敵人摧毀，於是繼續前行，途中收集到身體升級部件和模擬光碟 1。往前殺死Crimson Dynamo，再摧毀兩側齒輪機構，往前進入另一間控制室，發現這裡也被毀掉了，接下來隊員要前往上層甲板，Dugan則留下來通過監視器監視基地。
沿走廊遇到拿盾牌的士兵，跳到背後攻擊或抓住盾牌將他們扔出去。來到外部走廊，行進和戰鬥時要躲閃地上的紅圈，敵人的直升機會朝那裡發射飛彈。殺到盡頭來到上層的工程實驗室，存檔後往右開門到大廳，看到巨型容器裡躺著一些超級戰士，Mysterio控制神經中樞使他們甦醒過來，解決四名超級戰士到下一房間，聽到Bruce Banner求助的聲音，開門進去救出他，從桌上拿到Pym要的控制頭盔。出去清理兩名超級戰士，Bruce發現實驗室裡有一枚炸彈，於是前往第二間實驗室。往回走發現一道新的通道打開，進入右側寢室找到模擬光碟2。
在第二間實驗室下樓梯操作控制台解除炸彈，到下一房間遇到Mysterio，他派出兩名複製人協助戰鬥，觀察上方的血槽來判斷是否真身，殺掉他後乘電梯上去，有敵人上方跳下來，戰鬥的同時還要小心解除扔下來的炸彈(按炸彈上方顯示的方向鍵)。來到頂部甲板，往前看到平台上出現士兵，空中還有敵人的直升機，它墜毀阻住了去路。跳上平台殺光敵人，將鐵櫃由平台推下去砸開玻璃天窗，跳到下層走廊，打碎木桶找到人偶2。穿出去來到外面的停機坪，從直升機下來一群敵人，沿著外部通道清理過去，遇到一名組織士兵，跑到前方平台清理敵人操縱防空大砲將直升機擊落，隨後那名士兵會打開一道門。進走廊內部遇到阻路的 MODOK，他會問英雄們一些問題，如果答錯會遭到電擊，問題是隨機的，不管是否答對都會觸發戰鬥，料理所有敵人後上前操作控制台。
4：總部基地2(Stark Tower)
回到基地將控制頭盔交給Pym，再到窗前找Wingfoot談話，受托去通知Pym醫生檢查一下數據線。接下來與其他人對話，地圖上的紅X處通往鐵人實驗室，剛走出電梯遇到Weasel，原來他受托修理Black Widow的掌上電腦，需要找到讀取關鍵文件的密碼。與端茶的Jarvis談話，受托尋找丟失的護腕。回大廳在茶几上拿到護腕，再找Vision詢問 Nick Fury兄弟的事，再分別找Black Widow和Nick Fury談話，回實驗室告知Weasel掌上電腦的密碼是“Gabriel Jones”,在實驗室的桌上還有模擬光碟3。最後回到大廳與窗前的Wingfoot談話，一行人前往亞特蘭蒂斯。
5：亞特蘭蒂斯(Atlantis)
往前上樓梯進入水底管道，穿過去來到水底大廳，在入口對面的牆角拾到人偶3，用旁邊的控制台打開地面的艙門，一行人跳入水中。沿水底的廢墟一路遊過去，解決出現的守衛，在一道水晶艙裡找到被囚禁的Namor，殺掉附近看守用控制台釋放他，接下來要前往Negrete神殿尋找海藻為Namor療傷。
進入神殿往左打破牆找到隱藏地點拿技能點數，往前遊動左轉到大廳，用力打開一只巨大的貝殼(F鍵)拿到一顆珍珠，再搜索牆壁在右側密室找到模擬光碟 4。再到大殿另一側找到一道墓室的門，用力打開(小鍵盤數字6)拿到另一顆珍珠。沿大殿往上游過去，在右側大殿基座拿取一把三叉戟，在左側大殿找到一尊巨大的男子雕像，將兩顆珍珠放到身後的兩只基座上，再將三叉戟安裝到雕像手中的長矛上，長矛隨後凝射出一道白光打開前面的石門，進入石室在地上拾到海藻。
由傳送門回到廢墟用海藻給Namor療傷，然後前往亞特蘭蒂斯溝渠，在裡面遇到守衛的Byrrah和Krang，殺掉他們拿到王冠。往前遊動避開溝渠的水雷，拆除沿途的三座音速發生器。在一處角落遇到一名武士被夾在巨大的貝殼裡，將貝殼扳開救他出來，然後到附近的山坳找毀壞的潛艇，在旁邊的箱子裡拿到人偶4和斗篷。
進入王座沿通道殺過去，看到Tiger Shark和Attuma，跟過去從基座上拾起水珠，再將它放到前面大廳中央的基座上，兩側的石門打開湧出一群守衛，清光後進入兩側的房間，裡面均有一只巨大的深井，遊到深井對岸從基座上拿水珠。回到大廳將兩只水珠放置在石門兩側基座上，由打開的石門進入。在裡面打Tiger Shark和Attuma，他們游泳的速度極快，近身攻擊很難打中，控制遠程攻擊的隊員主攻。
將兩人打跑後操作旁邊的控制台打開地窖的洞口，進入地窖，穿過這片區域在末端找到洞口，由此進入競技場，Mandarin釋放出一只北海巨妖，它有地面和黑霧兩種攻擊方式，只能智取不能強攻。在海妖周圍有四根柱子，跑到一根柱子旁跑動，吸引海妖用拳頭將基座打壞，跑到基座藏身再伺機出擊，攻擊時要根據螢幕出現的躲閃方式來操作，共有數字鍵4、6和空格、F四種，五次正確即可引誘海妖將柱子擊斷，將四根柱子全部擊斷即可將海妖打回井裡去，最後遊到基座回到基地。
6：總部基地3(Stark Tower)
在基地與Nick Fury交談，得到前往Mandarin的宮殿奪取Ultimo藍圖的任務。前往鐵人實驗室與Weasel談話，他在破譯Black Widow電腦裡的資訊，需要他人的幫助但不知誰值得信賴。回大廳找Pym和Vision談話，回實驗室告訴Weasel 值得信任的人是C.B. Cebulski。到大廳前找Wingfoot談話，一行人前往精靈谷。
7：精靈谷(Valley of Spirits)
進入中國風格的大殿，往前殺掉幾名武僧，拉繩索打開木門，進入房間消滅一只龍人，沿宮殿一路殺過去遇到Ultimo1，打敗他往前到下一大廳，在這裡有武僧從地下的機關中出現，殺掉一群後會打開大門，從裡面跑出少林大師，將他們消滅進裡屋有存檔點，往前是金色宮殿。
沿盤龍踞鳳的宮殿前行，有成群的復活兵馬俑出現，並且兩側有旋刃的機關柱子(波斯王子？)，還好構不成太大威脅。往前在一房間裡找到武器箱，裡面有鐵人的手套。在下一大廳的兩側各有一間密室，需要跳到兩側的陽台上進入。右側密室裡有模擬光碟5，左側密室要找的Ultimo藍圖。
往前進入下一房間，四周排列著噴火的龍像，由陽台躍過火焰來到左側，開門進入走廊遭遇大群的兵馬俑，殺過去遇到Grey Gargoyle，一名泥灰色的武士，他擅長石化技能。附近還有幾名泥塑的法師，當Gargoyle瀕死的時候法師會復活加血，儘量控制會遠程進攻的角色戰鬥。
往前來到大殿殺一群少林武僧，到對面屋子有存檔點，盡頭是兩道木門，回到大殿往左側的房間探索，屋里都有大群的武僧，地上分別有三道踏板，將房間裡的箱子分別拖出來壓到踏板上會打開地上的暗格，找到拉桿扳下它。再到右側打武僧，將箱子拖到武僧跳出的井口上，將出現的拉桿扳下，如此兩道木門全部打開了。
回大殿由打開大門出去，打敗Ultimo2來到禁宮走廊。往前看到Strange醫生正在與武僧交手，眾人上前協助他清掉敵人，受托尋找一只被偷的魔法球。和醫生一道沿走廊前行，有不遠處有幾根旋刃柱子，將它們拆毀拿到模擬光碟6，這時由窗戶跳入一排武僧，料理他們進入下一間大殿，對面的大門被反鎖，走右側的樓梯，兩側各有一尊佛像，右側佛像前有一珠寶箱，從裡面找到醫生的魔法球。回到大殿殺出現的武僧，由打開的門來到上方的走廊，兩側各有兩尊佛像，打碎後在後面的密室找到人偶5。
往前遇到Mandarin，他會使用冰屬性攻擊，將隊員行動凍結，將他打掉半血後會逃到上方平台上，大廳地圖出現四只傳送點，不斷有Ultimo3和炸彈蜘蛛傳送出來。在平台下方的傳送點可進入Mandarin所站的房間，不過身後立即有Ultimo3將隊員扔回大廳，因此要想辦法將屋裡的 Ultimo3幹掉。站到傳送點後面，吸引炸彈蜘蛛爬到傳送點上，它會被傳送到房間將Ultimo3炸掉，隨後率隊員進屋打Mandarin，他掉一定血會跑到其它房間，同樣先炸掉Ultimo3再進去打，直到將Mandarin打敗為止。
拾起戒指後由傳送門回到總部，從Fury處得知兩名X戰警被敵人劫走，到窗前與Wingfoot談話前往Strange醫生的住所。
第二幕
8：秘密基地(Sanctum Sanctorum)
來到醫生位於格林威治的鄉村老宅，與醫生會話後，上樓梯到左側走廊，在屋裡找到Nick Fury，總部的很多成員都搬到了這裡，這裡成為臨時的總部基地。與總部的成員對話可接到一些支線任務：在大廳桌上拾到一顆寶石，將它安置在魔鏡上，鏡裡出現的一道人影，他是醫生的老師。Vision要求給他找一本書，到樓上的避難所與Weasel談話，Cebulski正幫助他完成電腦的破解工作，只是還需要總部的安全模塊。在樓上的書架上拾到Vision要找的歷史書，旁邊拾到人偶6，在房間另一側的書架前找到模擬光碟7。回樓下將書交給 Vision，再向他索取安全模塊，再回樓上將安全模塊送給Weasel。完成所有支線後，利用樓下的傳送水晶前往Doom的城堡。
9：肅殺世界(Murderworld)
來到城堡，與Nick Fury通話後沿大廳前行，兩側牆壁的畫上跳出很多守衛，清掉後上台階進走廊，這裡有很多上下移動的柵門，利用升起的瞬間快速閃過去。來到餐廳清理守衛，餐廳附近有5個小房間，一側房間有人偶7，另一側有模擬光碟8。由一側的門出去到走廊，這時前方出現多道柵門，眾人的身後有道裝有釘板的牆壁沿走廊撞過來，這時率隊員快速往前衝，用遠程攻擊將前方的敵人消滅，並逐道擊破柵門，由盡頭的門逃出走廊。之後再回到走廊，將牆壁推進去到密室寶箱拿寶物。穿過大廳到後面的走廊有很多的牢房，往前遇到X戰警之Jean Grey，她神志不清與眾人交手，等她跑開後，眾人分析她是受到Arcade的意念控制。
沿走廊來到外面的馬戲團營地，在平台左側拿到模擬光碟9。在這裡要對付大批的小丑和機器人，在這裡救出Senator Kelly，然後進入帳篷找Jean談話，不想她再次動手打了起來，取勝後她被吸入一台遊戲機裡，這時一輛小丑吉普衝進帳篷，打倒所有圍攻的小丑，從吉普車裡拿到遊戲幣，將它投入遊戲機裡開始玩迷你遊戲，控制角色跳躍所有的障礙抵達關尾救出Jean。
往前進入彈子球迷宮，解決小丑的同時還要小心途中的機關和地上的紅圈，它們都會對隊員造成傷害，在迷宮有兩處斜坡可以跑上去，分別打敗BOSS- Rhino和Shocker，再將迷宮中所有Arcade頭像的牌子打碎得到100萬點，這時會有很多的乒乓球由空中墜落，跑到迷宮盡頭的存檔點處拿黃金入場券。
回到馬戲團的帳篷，進入露天市場到一頂小帳篷裡拿錘子，用它破開一道木門，裡面有碰碰車可以開動到處遊逛。拿到錘子走到一道柵門旁，用錘子砸門邊的測力器，用它升起柵門到下一區域。玩機械爪的遊戲可救出Blade，要根據螢幕出現的提示按對應的鍵。穿過後面的帳篷進入死亡迷宮，這裡要扳動手指來打開通道，同時也會啟動附近的機關，如果隊員站錯位置便會受傷或死亡。在迷宮一角拿到模擬光碟10，拾到錘子敲打測力器打開末端的柵門，進入帳篷開始玩碰碰車，將敵人的所有碰碰車撞毀拿到黃金入場券。
回到帳篷將兩張黃金入場券交給檢票員，由此進入娛樂室，進入右側的3號室，結果退路被一道石牆阻住，殺掉出現的小丑從地上拾到人偶8，回身打碎石牆返回大廳。進1號室，清除裡面的敵人後玩一個迷你小遊戲，按F鍵抓住白色托板，用A和D鍵左右移動，用乒乓球撞掉上方的方塊，全部清除後完成遊戲，大廳的2 號室門打開。
進入2號室門聽到Arcade的談話，隨後房間裡響起死亡迪斯科，兩排小丑夾擊過來，一路攻過去最後扳動一隻手墜落到底部的黑洞中，Arcade駕駛著一副機甲朝眾人進攻，這裡只能智取，在地上有兩個陷阱，掉進去會被裝入人肉大砲，確定當機甲站到中央的位置再跳入陷阱，隊員會被大砲打到機甲的頭頂，這時按螢幕出現的提示狂按對應的鍵，會打掉機甲一定血量，如此反覆將機甲摧毀，由出現的傳送門返回基地。
10：惡魔領地(Mephisto's Realm)
在基地與Wong談話，他請求眾人前往惡魔領地時留意尋找陰影女王之眼，再到避難所找Weasel，得知他從電腦中破譯出一些資訊，組織正在籌謀一項“戰神計劃”，然後使用傳送水晶前往惡魔領地。
這裡是鎔岩地帶，遭遇多樣的魔物，有一種妖精會跳到角色的後背，這時要狂按F鍵彈開它。在起始點的右方燈架旁拾到模擬光碟11，往前殺過去看到中央有五根蠟燭的星芒陣，附近通往5座競技場，每座競技場取勝便會點燃一根蠟燭。
其一：有3只飛龍，跳到深坑裡拾起斧頭，掄起來(數字鍵盤4或6)將3棵樹砍斷，這樣飛龍便能殺掉了。
其二：進去殺4只小妖，打開魔法門進去拿一支火把，用火把將外面的4只火盆點燃。
其三：正中有圓形的熔漿池，傳送門在正中的升降臺上，附近不斷有小妖出現，用F鍵抓住小妖，再用移動鍵選擇方向將它扔出去，將小妖扔到熔漿池中會使升降台落下一節，直至傳送門落到底部。
其四：在正中有一座祭壇，附近的空中浮有鐵環，將所有敵人都殺死在祭壇上，他們的靈魂被拘禁在鐵環裡不再復活。
其五：在場中有四座墓地，不用理會敵人，直接將四座墓碑打碎即可打開傳送門，其中一座墓穴里可拿到人偶9。
當5只蠟燭點亮後，由正中出現的傳送門前往地獄。過橋後從溶漿裡跳出一只巨人，打倒他往前上樓梯，往左側通道找到陰影女王之眼，右側通道的雕像前是技能點數。前方有兩座石橋，左邊是斷掉的，過橋後在兩座橋之間找到一棵樹，在樹下拿到人偶10，此時拿齊了所有Daredevil的人偶，角色 Daredevil解鎖可用。
殺掉兩只鎔岩巨人，往前過橋看到一個有星芒陣的祭壇，正中鎖著幽靈騎士，要救他須將附近4只栓鐵鍊的石鎖打破，每只石鎖都由一名熔漿巨人看守。將石鎖全部摧毀後，用祭壇釋放幽靈騎士，他會加入隊伍。
往前進入墓地，在兩側房間各有一只武器箱，往前一間墓室裡拿模擬光碟12。沿墓地通道殺過去，解決兩只熔漿巨人，過兩座橋遇到BOSS- Blackheart，他使用遠程魔法攻擊，派近戰隊員纏住他，再切換到遠程攻擊的隊員打，他會利用附近的小塔復活，在戰鬥間隙跑到四周將小塔摧毀，這樣只打敗他一次便可結束戰鬥，否則他會復活6次。 往前要做出選擇，走左側救Nightcrawler，走右側救Jean Grey，救下一個另一個則會摔死。
往前來到地獄深淵，Mephisto召喚出大群的怪物與眾人混戰，清理一批後跳到左側山頂拿模擬光碟13。往前找到深淵跳入底部的傳送門，在深淵底部與Mephisto展開戰鬥，BOSS非常強悍，先繞著他打游擊，不要被他抓住或遠程魔法擊中，等他拿出劍來再上前奪取，用他的劍將正中祭壇周圍的5尊雕像砍碎，正中被封印的Jean Grey復活，在開始她會聽從Mephisto的命令，打她幾下使之恢復神智，最後她幫助眾人將Mephisto消滅，由出現的傳送門返回基地。
第三幕
11：瓦爾哈拉殿堂(Valhalla)
這裡是第三幕的總部，是傳說中的仙境，如今這裡被魔軍攻擊而需要人類的協助。首要的任務是前去打開連接天地的彩虹橋，其二是解救被關押在仙宮監獄裡的神仙Balder。在與獨眼龍對話後，前方有兩條路分別通往彩虹橋和仙宮。
12：彩虹橋(Bifrost Bridge)
在入口跳到左側石台上拿模擬光碟14，往前走遇到奧丁神的婢女Valkyrie，她要眾人幫她拿回丟失的龍牙劍。往前上橋遇到一些魔兵，儘量利用螢幕提示的組合鍵來打，尋常的魔法攻擊是不管用的，由橋右的路經經過一艘海盜船，船首拾到人偶11(XP)。往前是迷宮般的路徑，穿出迷宮有3條路可走，它們分別通往3座石崖，正中是奧丁神的石像，兩側的石崖都可到達對面。若走右側通道看到盡頭有塊石板，將路邊一根石柱拖上去，身後出現一只寶箱，從中拿到人偶 12。再走到石崖上用遠程魔法將遠處石台上的4名弓箭手射殺，崖邊的4只符號發亮，將它們踏亮，奧丁神的手托起通道，由此可達對面。若走左側的路到石崖，這裡有4塊石板和4根石柱，按照符號將石柱拖到對應的石板上，再將地上的符號踏亮，奧丁神像的手臂托起一塊陸地，由此來到對面懸崖。
來到山崖對面從石中撥起Valkyrie的龍牙劍，再轉動正中的齒輪，跳到移來的浮石上打開通往人間的大門。沿石橋跑過去左轉，在盡頭拿模擬光碟 15，再走右邊避開噴火的雕像攻擊，殺到末端將吊橋推倒繼續前行，在橋末端有三只火龍朝這邊噴火球，小鍵盤5可就地翻滾來加速移動，躲避連珠般的火球跑到火龍身後存檔休息。推到吊橋來到下一段，在前方的陸地與4名船員展開混戰，將他們全部打倒後，清理障礙打開大門。
回到基地後前往勇士大廳門前，與守衛談話可以進去了，在餐廳的一側拿到模擬光碟16，另一側拿到人偶13(XP)。按攻略流程打的話，至此Black Panther的人偶也算弄齊了，之後出現人偶的地方以XP來代替。
13：仙宮(Asgard)
在開始前方有兩條路，它們通往相同的地方。往左走發現身周所有通道被封閉，一群巨人圍殺過來，奮力將他們全部消滅，正中的石頭上出現一把維大(奧丁之子，森林和平之神)之錘，拿起錘子將前面的石柱擊碎，往前有巨型鐵砧和一道封印門，用錘子敲擊鐵砧將封印門解除，沿空中懸浮的草徑前行，最後找到一尊雷神托爾的雕像，這時用附近的存檔點將Thor換到隊伍，使用它的雷電技能(5)攻擊雕像，前方的大門被打開。
往前走看到被鎖住的光明之神Balder，在解救他之前要先去營救他的兄弟戰神Tyr和天界守衛者Heimdall，在他兩側各有一道門，先由左側進入奧丁庭院的西翼。在庭院調查前面的雕像，解決掉衝進來的超級戰士，進走廊殺掉幾只狼，左側盡頭有武器箱。往前穿過兩道門殺戰士，來到下一條走廊找到一只大箱子，將它拖到走廊的另一端踏板上打開密室的門，從中拿到戰神手套。
來到下一座有熔漿池的大廳，一只狼首(Fenrir，神話中被諸神捆住的狼怪)叨著一柄大劍橫穿熔池，站在劍柄處放上戰神手套，這樣狼嘴張開，眾人沿著劍身穿過熔池。來到下一房間，將正中的雕像推到右側木臺上，開門往前來到鑄煉室，在前方看到Tyr被吊在熔漿池的上方，旁邊有蠍子和蜥蜴守衛，戰鬥時離熔池遠一些，小心被扔進去喪命。將兩只BOSS解決後，不要去碰高臺上的兩只拉桿，在救Tyr之前須先要將下方的熔池冷卻。
推門來到相鄰的大廳，清光怪物後跳到底層拿模擬光碟17，附近還有兩只武器箱子。殺到下一大廳，這裡是鑄造車間，有鐵砧和熔爐，先到右邊桌上拿金屬塊，將它放到熔爐裡，再用旁邊的風箱吹起火焰，再從桌上拿到鐵鉗將熔爐裡的金屬取出來，將燒紅的金屬放到鐵砧上，到桌子上拿鐵錘將金屬鍛鍊成一件盔甲。
拿起盔甲沿著連串的房間搏殺過去，來到一個有巨大熔漿池的大廳，跑到左側平台找到一只大鍋，用繩索將它翻倒，傾注的清水流到各處，當初大廳Tyr下方的熔池被冷卻了。沿房間繼續走找到兩支拉桿，用它們打開大門回到最初的大廳，再用高臺上的拉桿解救被吊的Tyr。
回到Balder被拘禁的地方，進入奧丁庭院的東翼，調查前方的雕像，往前殺超級戰士和守衛，擊碎兩側的公羊雕像打開前面的門。下一座大廳的大門緊閉，兩側各有一道門通往有雕像的房間。由右側的門到裡間找到一隻手柄，用它將牆上的雕像轉向前方；回大廳走左側的門，在房間裡轉動手柄便雕像面朝左方，這時大廳裡的門被雷電擊碎。往前到走廊殺一群守衛，會放電的要用遠程魔法殺掉，將雕像推到左端木臺上打開大門，進去收集道具。由走廊右側的走廊進入前面的豪華大廳。
穿過幾個房間看到走廊上有一道封印門，前方有兩座被藍光包裹的按鈕。注意兩側各有一條通道，左側通道通往有紅X的房間，進去後門被封住。在屋子裡找到 3個白色的石匣，分別打碎擋板將裡面的石塊拖出來，分別放置在屋中央的踏板上，石塊和踏板上的圖案要對應。再到右側走廊，身後的門被封閉，這裡有3間石室，裡面各有一名巨人，分別打敗他們拿到古符紋，返回屋子將拼成的符紋放置中央的臺上，走廊上那兩個按鈕的藍光消除。回到走廊派兩名隊員同時按下按鈕，前方的封印門消失。
在下一座大廳找到被冰封的天界守護者Heimdall，先收拾掉大廳裡的Shocker和Rhino，再分別到兩側房間轉動4座推桿，升起4座鏡子的鐵籠，再到大廳轉動鏡子將4道光柱照在中央的冰塊上，冰塊消融釋放出Heimdall，接下來要為他拿回丟失的號角。往回走有一道門自動打開，由此進到另一房間，殺掉敵人到左側拿模擬光碟18，切換有飛行能力的隊員越過前方的斷橋拿到號角，回來交還給Heimdall。
回到拘禁Balder的地方，這時劊子手和女巫出現阻攔，先重點收拾女巫，她會迷惑隊員並給劊子手回血，在她施法時候按小鍵盤4-4-6組合鍵攻擊，打倒她再用物理攻擊修理劊子手。
回到基地與每人談話，再找Weasel詢問一下電腦破譯的進展情況，然後向獨眼龍報告懷疑黑寡婦是Doom派來的間諜。
14：魔法大陸(Niffleheim)
由水井來到這片冰雪覆蓋的大陸，遇到女巫Volla要眾人幫忙找回她的指環。往前遇到失事的船隻，殺掉甦醒過來的武士，沿雪原一路清勦過去，過一道雪橋遇到Ulik和Kurse兩名BOSS，Ulik較為難打，建議使用武器攻擊，或使用美國隊長的全員防禦和蜘蛛人的降速技能。
將BOSS解決後發現船邊的箱子打不開，繼續前行找到存檔點，在右邊拿模擬光碟19。在旁邊的小木屋前有火堆，調查它拿到一把鑰匙，用它打開先前的箱子拿到女巫Volla的指環，之後再到這裡可拿到模擬光碟20。
返回到存檔點往前進入戰場，左走會觸發戰鬥，徑直走將阻路的圓石推開，往前有投石車朝這邊扔石塊，一邊戰鬥一邊將路旁的燈塔點亮，穿過一片冰面找到投石車摧毀它，再操作旁邊另一台投石車將遠處阻路的石塊砸碎。一路殺過去在深坑裡發現奧丁使用的黎明之劍，只是它目前斷掉了，看來奧丁神在戰鬥中失敗了。
往前來到巨人領地，這裡的BOSS是北歐神話中的巨人始姐Ymir，諸神曾用其遺體創造世界。Ymir的打法類似於之前的Arcade，首先解決不斷出現的小兵，搶奪一把長予在手，等Ymir的棒子錘擊地面的時候沿著棒子跑上去，按照螢幕上出現的按鍵提示操作，最後繞到它的頸後狂按“小鍵盤6鍵”將長予插進去。如此反覆插4次長予即可殺死這只巨型怪物。
往前沿雪嶺一路殺上去，過石橋後往左跳上石柱拿模擬光碟21，繼續前行找到存檔點，不遠處遭遇Baron Mordo和Ultron兩只BOSS，重點解決Mordo，他的冰系攻擊會凍結隊員。殺完BOSS要從兵器架上選擇正確的長予，身上有Volla指環的話便會知道正確的是哪個，有支長予會閃爍光芒，拿下它就是了，跑到門前用長予將火神Loki的魔法門解除，進去將Loki打倒再用傳送門回到大廳。
接下來要收集4把神劍，用牆上的傳送門來到一間屋子，前方有3道大門，屋裡有3塊圓形踏板，用Ctrl鍵切換3名隊員站到踏板上，第4名進入密室拿神劍。回大廳進入另一側牆上的傳送門，這間屋子正中有把搖擺不定的劍，直接上前拿起即可。回大廳往裡端走又有兩道傳送門，進入左側的房間發現地上排列的花紋，沿著粗紋的圖案走到裡端拿神劍。第四道門通往外面的山壁，利用牆壁爬到第三層的懸崖上，途中要躲避山洞間歇噴射的寒氣，跑到末端拾到神劍。
收集完4把神劍跑到大廳的雕像前，每名隊員手持一把神劍將雕像的冰層破掉，裡面的破壞神甲展露出來。這時Loki再次出現在眾人面前，不用理會攻擊的神甲，跳入傳送門追蹤Loki，進錯傳送門會觸發戰鬥，解決敵人再返回大廳尋找正確的傳送門。最後在房間裡找到蹲伏躲在冰層裡的Loki，這時全力攻擊跟過來的神甲，使下方的氣槽蓄滿，等它爆炸的時候會震開Loki的防護罩。往前進入傳送門見到Dr. Doom，得知他已吸取了奧丁的能量，將奧丁關在了烏鴉山頂……
第四幕
15：外星帝國(Shi'ar Empire)
在皇家圖書館與出現的蠻王Watcher對話，原來在Doom要殺掉眾人的瞬間，他施展力量救了大家，目前組織的基地便轉移在這顆行星上。想要打敗擁有奧丁神力的Doom，須在遼闊的外星世界尋找兩件重要的道具，其中之一是可穿越時空的水晶碎片(M’kraan Crystal)。到皇家庭院找Crystal談話，然後回到圖書館與那條狗Lockjaw談話，進入太空戰艦的停機艙裡。
如今的任務是前往引擎室摧毀超光速推進裝置，在開始與Corsair談話，得到從邪惡姐姐Deathbird手中營救Lilandra公主的支線任務。往前將幾只阻路的箱子拖出來，上樓梯來到停機艙上方的人行通道，往一側拿模擬光碟22。上樓梯來到居住區域，發現前方被敵人用光柵門阻住，回到機艙沿通道跑到末端發現敵人用控制台打開兩道機艙的窗戶，此時不要戀戰，小心腳下不要被強力吸入太空，跑到控制台處將窗戶關閉。前方的通道被兩道光柵門封鎖住，由機艙兩側的門進入工作人員居住區，用屋裡的控制台打開光柵門，等兩道光柵消除回到機艙，Corsair離隊。
往前來到戰艦的能量中心區域，前方通往引擎室的門被守衛鎖住了，需要兩張鑰匙卡才能打開。清除出現的戰士和機器人，往右側路徑下樓梯，殺掉一名頭頂有黃色箭頭標誌的士兵拾到鑰匙卡，在附近還能拾到模擬光碟23。返回走左側的通道，前方的門直接摧毀通過，殺掉士兵拿到第二張鑰匙卡，回到門前派兩名隊員同時將兩張鑰匙卡插入控制台打開通往引擎室的大門。
前方有存檔點，乘電梯降到下一層，在這裡遭遇BOSS- Gladiator，這個傢伙同樣無法以力量取勝，在平台四周有四座控制台，分別將它們啟動會有鏡子朝正中的球體投射光線，球體的光線會打到 Gladiator的身上，這時是他最虛弱的時候，集中火力上前猛攻，等光線消失再重複操作控制台製造下次進攻的機會，直至將他打倒。
沿通道往前穿過幾個房間，用控制台打開艙門來到戰艦外部，在通道上遇到BOSS- Starbolt和Warstar，首要收拾擅長近戰的Warstars，然後再打遠程射線攻擊的Starbolt，將兩者打敗後，往前看到有黃色箭頭的控制台，將它打碎後解除掉前方艦砲的電子防護罩，再跑過去逐台摧毀大砲。飛到上方打碎玻璃落到下面的房間，拾到模擬光碟24。大砲共有6座，先摧毀前面的 3座，再往前找到碟形衛星天線，轉動它到正確的方向發送一段資訊。前行一段路找到餘下的大砲，摧毀後跑到末端打開艙門進入觀測艙。
沿走廊到裡面的控制室遇到Hussar和Neutron，打倒他們兩個再到下一房間打BOSS- Deathbird，戰鬥開始很簡單，打掉她半血後房間正中的水晶會給她加防護罩，當她飄在空中並有防護時是不受任何攻擊傷害的，這時要攻擊正中的水晶解除她的防護，然後用遠程攻擊打她。她有時會抓起一名隊員飛在空中，這時要螢幕的提示按鍵，可以將她抱住衝向地面造成傷害。
將Deathbird打敗後跟著她進入正中的傳送門，看到Deathbird已啟動戰艦的自爆程式，螢幕上出現1分鐘的倒計時，不用著慌，退出來走左側通道，在房間一角找到電源節點，迅速打碎它，時間增加30秒，穿門出去左轉找到第二個節點，在下一房間找到被困的Lilandra公主，先將房間裡的節點打碎，再跑到外面走廊打節點，等時間積累到2分鐘左右再回房間打控制台，控制台很難打，大致要花費1分鐘的時間，摧毀它後將被困的公主解下來。
最後來到Deathbird所在的房間，阻止她爆破巨艦只有摧毀下層的4座控制台，救下戰艦後接受公主的感謝。往前到房間操作控制台解除掉裡間水晶外的防護罩，進入裡間將水晶打碎拿到碎片，再利用傳送門返回。
16：斯科盧爾行星(Skrull Planet)
根據Watcher的提示，大家接下來要尋找另一件道具-介子吸收器，它為外星民族的Galactus擁有，這個民族曾數番入侵地球，妄想統治人類。開始位於太空高塔，往前走收到獨眼龍的提示，在這裡有很多的魔法能量發生器，是外星民族保護自己行星製造魔法屏障的能量來源，要沿途摧毀它們。往前走觸發戰鬥，在走廊上拿到模擬光碟25，沿走廊繼續廝殺找到第二座發生器，摧毀後會將通道炸斷，跳過去可由右邊通道繞過去。往前上樓梯穿過平台摧毀第三座發生器。
往前來到航空研究學院，在這裡遇到Super Skrull和Paibok兩個傢伙，他倆躍躍欲試的要進攻，隨後斯科盧爾女皇現身，只須替她打開機艙的大門便將Galactus弱點告訴給眾人，接著要從兩名她的兩名手下中挑選嚮導，Super Skrull以魔法見長，而Paibok則以力量和耐力見長。選好嚮導由一側的通道穿到機庫大門的後面，這裡是個較漫長的迷宮，最後走到上方天橋找到控制室，打開機庫大門後返回大廳見女皇，不想這個老太婆耍賴，兩名手下開始攻擊，殺掉他們後來到外星城市街道。
來到街道天橋看到背景有Galactus龐大的身影在走動著，沿空中天橋前行拿模擬光碟26，在戰鬥的時要小心地上出現的圓圈，會有戰艦朝這裡投炸彈，要注意閃避。往前走看到一台巨大的鑽井，那是Galactus用來摧毀這座星球的東西，將鑽井上的三個圓孔摧毀。第二台鑽井在遠處，兩側各有兩個圓孔，近身攻擊不能打到，用遠程分別將它們摧毀，這樣兩台鑽井停止工作，解除這座悲慘星球的厄運。往前走會引起Galactus的注意，派出一群敵人圍攻，沿天橋往左側殺過去拿模擬光碟27，走另一邊到達城市高層區域。前方的高台可以飛上去或跳上去，拿模擬光碟28，旁邊是存檔點。
沿走廊前行遇到Titannus，他擅長近戰，控制遠程攻擊的魔法師不斷放技能，打掉他一部分血他會心煩意亂地破壞幾個房間，這時是攻擊的最佳時機。打倒他之後往前到牢房區，派兩名隊員同時操作兩個控制台打開牢門，與裡面的科學家談話可提升等級。
往前來到城市街道，在這裡要與身形巨大的Galactus戰鬥，在開始拚命往右方奔跑，隨著Galactus的移動，城市中的天橋和樓宇紛紛倒塌，途中他會用手指的雷射擊倒一座高塔，利用斜坡跳上高塔跑到高處平台，沿著平台一路殺過去遇到Silver Surfer，接下來跑到天橋三個地方去啟動控制台，途中如果有隊員被Galactus捉到手中，要按螢幕提示操作來逃脫。啟動全部控制台後，三座高塔散發出桔黃色的光芒，這時Silver Surfer踏著衝浪板到空中攻擊Galactus的頭部，按螢幕提示操作，這裡要求速度很快，難度也是整個遊戲中最高的部分，完成五六次按鍵攻擊得手，會打掉Galactus三分之一的血，接下來再重複之前的操作，直至將Galactus打倒為止，最後用傳送點基地，再與大狗交談回到地球。
第五幕
17：毀滅基地(Doomstark)
回到第一幕的基地，這裡的形貌已完全改觀，原來Doom不但將這裡的形貌改變，地球上的所有大城市都被他改變了，他的威力由此可見一斑。接下來要做的是重新啟能源，使基地恢復運作。分別跑到三座平台啟動電能連接器，這時有一群機甲人攻入基地抓起獨眼龍逃往鐵人實驗室。
進入實驗室接收到Pym博士的資訊，他要利用3分鐘的時候修復基地的防禦系統，在這裡防禦3分鐘的時間，然後回到大廳與Nick Fury談話，再到窗前找Pym對話，受托尋找兩件道具：魔法加濕氣和技術手冊，這兩件東西在大廳中央和一角的平台上，將它們交給Pym，他製造一種吸引光線攻擊的裝置送給眾人。最後與Nick Fury交談前往Doom博士的城堡。
18：末日城堡
由開始的大廳前行，空中落下石塊壘成一道旋轉階梯，往左走到二層，又有一道石頭天橋鋪就，通往大廳的另一側，沿著它走過去閱讀書架上的經書，到裡間發現又有一道石橋升起來，往前進入有很多道門的大廳，這裡只有一道門是出口，就是剛才進入的大門，它位於大廳左端。在下一房間有一個大坑，毫不猶豫跳下去。
往前上階梯看到一尊Doom的雕像，調查它得知要尋找三件道具：手套、盔甲和面具。往回走到右側平台開門進入Doom的居室，在大廳遇到成群的敵兵，在一間書房挪動書架找到隱藏密室，裡面有武器箱。再到大廳另一側移動書架，由後面的密道穿過去找到存檔點。
再往前遇到BOSS- Dark Captain America和Dark Colossus，打倒兩人往前上階梯到密室，從案臺上拿到手套，這時腳下坍塌，眾人掉落到下面的水塔的水池中。
來到水塔內部收拾成群的末日巨人，沿樓梯一路殺上去，由頂部的門進入巨洞之中。在洞中央的平台上收拾掉BOSS- Dark Psylocke和Dark Cyclops，他們分別在平台的上下兩面，先解決掉Dark Psylocke，再跳入下面的深淵到達平台的反面殺Dark Cyclops，全部解決後進入旁邊打開的大門，在走廊的台案上拿到盔甲，這時身後出現十餘名敵人，解決後由走廊末端的門到實驗室。
這時收到Fury的消息，得知附近有件蛇發女妖的武器要找到，名為終極毀滅兵器(Ultimate Nullifier)。按著地圖上的標識一路殺過去，在一個房間裡找到毀滅兵器，不過它被Doom毀壞了。
往前穿過有綠色光柵的走廊，在大廳前端有道深淵，正中是正反旋轉的石輥，沿著它走(飛)到對面，穿過走廊來到下座大廳，這裡看到奧丁神被困在一座金屬機器裡面，往前遇到Dark Thor和Dark Spider-Man，殺掉Dark Thor拾一把錘子，用它敲碎囚禁奧丁神的機器，救完奧丁到另一側的案臺上拿面具。由對面上台階回到城堡大廳，將三件道具放到雕像上，在雕像前方出現一道前往王座的傳送門。
在王座遇到Doom博士，他派出黑暗神奇四俠出擊，最好用蜘蛛給敵人降速，再切換近戰角色給予強擊。將黑暗四俠解決後，Doom博士離開王座戰鬥，在開始他是無敵的，渾身被綠色的光芒籠罩著浮在半空中，有五道光芒投射向他給予能源的支持，這時派一名會飛的隊員到大廳四周打那五座發出綠光的雕像，每打一個會出現一名黑暗神奇四俠成員，不用管他們，等將五道綠光消除後再到大廳中央與Doom博士對峙，乘機吸引他體內的能量(根據螢幕的提示操作按鍵)，然後他會掉落地面，一起上前圍毆吧!隨著Doom博士的戰敗，世界歸復和平，但一切並未就此結束，黑暗的勢力仍在某個角落蠢蠢欲動。
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